食品药品厂设计施工与其他工业厂房的差异在于食品洁净厂房内的出产工艺有空气洁净度要求；医药工业洁净厂房与其他工业洁净厂房比较，空气洁净度标准又有微生物的控制要求。其间，无菌药品对出产环境的微生物量控制更为严厉。但是，室外大气中含有许多尘粒和细菌，据有关资料标明，不同区域环境的大气含尘、含菌浓度有很大差异

空气中影响药品质量的污染物质不仅仅微粒，另一个重要的污染物质是微生物。尽管大多数微生物对人无害，致病菌仅仅其间少数，但微生物的生计特色使得它对药品的危害性比微粒更甚。微生物多指细菌和真菌，在空气中常黏附于微粒或以菌团办法存在。

药品受微粒和微生物污染后会蜕变，一旦进入人体将直接影响人体健康，甚至危及人的生命安全。因此，与其他工业洁净厂房不同，医药洁净室(区)有必要以微粒和微生物为环境控制的首要方针。

医药工业洁净厂房中工艺设备用电负荷等级应由其对供电牢靠性的要求确定。此外，厂房净化空调体系的正常运转与药品出产密切相关，医药洁净室(区)空气洁净度对药品质量影响很大。对这些用电设备的牢靠供电是确保出产的条件。医药工业洁净厂房一旦停电，室内空气会很快污染，严重影响药品质量。同时，医药工业洁净厂房是密闭厂房，因为停电形成送风中断，室内新鲜空气得不到弥补，有害气体不能排出，对人员健康不利。因此，有必要坚持医药工业洁净厂房净化空调体系的正常运转。